El alcalde es el presidente de la Corporación y ostenta, entre otras atribuciones, la de dirigir el Gobierno y la Administración municipal, representar al Ayuntamiento y convocar y presidir las sesiones del Pleno, la Junta de Gobierno Local y de cualesquiera otros órganos colegiados. El gabinete de Alcaldía, que incluye el servicio de Protocolo, se encarga, entre otras cuestiones, de las relaciones institucionales y exteriores, de la coordinación y supervisión de actuaciones de proyección exterior, de la dirección de los actos oficiales y conmemorativos de la ciudad y de promover las relaciones del Ayuntamiento con las ciudades hermanas.

A lo largo del año 2011, se llevan a cabo 190 actos municipales entre los que se incluyen los actos institucionales (Voto de las Cinco Llagas; Vísperas, Procesión y Octava de San Fermín; Privilegio de la Unión y festividad de San Saturnino), otros usos y costumbres en los que participa la Corporación municipal, 25 recepciones en la Casa Consistorial, 70 actos con participación de la alcaldesa o el alcalde y 7 visitas a personas centenarias. Además se realizan 74 visitas guiadas a la Casa Consistorial a diferentes grupos, colectivos o colegios.

El Ayuntamiento de Pamplona celebra en la Sala Felipe II de la Ciudadela 181 bodas civiles, el mismo número que en los dos años anteriores. Del total, 171 enlaces se realizan en castellano y 10 fueron bilingües castellano – euskera. Se celebra una boda entre personas del mismo sexo. Durante el mes de agosto no se celebran bodas civiles y desde octubre se amplía el horario de las ceremonias, que pueden llevarse a cabo todos los viernes de 18.30 a 20 horas y los sábados de 12 a 13.30 horas. Debido al cambio de Corporación derivado de las elecciones del mes de mayo, hasta 31 concejales del Ayuntamiento de Pamplona presiden al menos una boda civil. La persona que preside la celebración es el alcalde de Pamplona o el concejal de la Corporación en quien delegue, aunque también los novios pueden elegir qué edil les casa.