En el área de Gobierno Transparente se agrupan, fundamentalmente, las funciones y competencias que hasta ahora desarrollaban el Gabinete de Alcaldía y la Gerencia Municipal, a las que se suman otras nuevas funciones. A ella se encomiendan las relaciones del Ayuntamiento con la sociedad mercantil “Asociación Navarra de Informática Municipal, S.A.” (ANIMSA), así como con el Defensor del Pueblo y la Cámara de Comptos. Es un área que depende directamente del Alcalde. El objetivo fundamental es crear una forma de gobierno nueva basada en la total transparencia, facilidad de acceso a la información y en la participación social en las decisiones municipales. Además se promoverá la modernización, coordinación y racionalización de la administración municipal. El área se divide en cuatro ámbitos de trabajo:

a) Gabinete de Alcaldía, Protocolo y Comunicación

• Asesoría, asistencia y secretaría del Alcalde.
• Relaciones institucionales y exteriores.
• Protocolo.
• Coordinación y supervisión de actuaciones de proyección externa.
• Dirección de los actos oficiales y conmemorativos de la ciudad.
• Promover las relaciones del Ayuntamiento con las ciudades hermanas.
• Cuentas de Alcaldía
• Trasladar a la ciudadanía, a través de medios propios o de los medios de comunicación existentes, la actividad municipal.
• Coordinar y dinamizar las diferentes herramientas de comunicación de las que disponemos o podemos llegar a disponer, así como el personal municipal dedicado a esta labor.

b) Coordinación técnica de la Administración-Gerencia Municipal

• Realizar una coordinación técnica del funcionamiento de las áreas de gobierno mediante la Mesa de Coordinación Técnica con participación de las direcciones de todas las áreas con carácter periódico y propondrá espacios de encuentro entre las áreas si no existiesen. En esa mesa participarán, con carácter permanente, los servicios de Igualdad y de Política Lingüística para asegurar una correcta implantación transversal de sus planes de actuación, así como las acciones destinadas a garantizar la accesibilidad universal.
• Ordenar y tutorizar la implantación de la administración electrónica y las relaciones del Ayuntamiento con ANIMSA.
• Liderar y coordinar las “candidaturas” a líneas de subvención estratégicas que ocupen a más de un área.
• Las Memorias municipales
• Relaciones con el Defensor del Pueblo y la Cámara de Comptos.
• Padrón.
• Registros.
• Registro de parejas de hecho, matrimonios civiles.
• Servicio de Atención a la Ciudadanía.
• Archivo Municipal
• Proposición de los planes de actuación y ejecución de los objetivos del Ayuntamiento, y asignar los recursos necesarios para su ejecución, de acuerdo con las normas presupuestarias correspondientes.
• Seguimiento del cumplimiento de los compromisos e indicadores que ha asumido el Ayuntamiento, trabajando con todas las áreas y definiendo un cuadro de mandos integral.
• Promoción y supervisión del cumplimiento de todas las actuaciones de búsqueda de la calidad de los servicios municipales.
• Evaluación de los programas de actuaciones, formulando las propuestas de reforma o supresión que fueran necesarias.
• Propuesta de asignación de recursos anuales, en los presupuestos, a cada una de las áreas.
• Propuesta a los órganos de gobierno de los asuntos que les correspondan en el ámbito de sus competencias.
• Propuesta a la Junta de Gobierno de la aprobación de los proyectos de disposiciones de carácter general y las demás propuestas que correspondan en el ámbito de sus competencias.
• Emisión, en su caso, de informe sobre las modificaciones organizativas, incluidos los proyectos de organización y estructura de cada departamento o área.
• Implementación de nuevas aplicaciones informáticas que mejoren la relación con los ciudadanos.

 c) Sociología

• Realizar análisis de prospección sociológica que nos ilustren acerca de la realidad social de la Ciudad y sus transformaciones (de situación y alcance de la pobreza, de la situación de la vivienda, del conocimiento y uso del euskara, de la evolución demográfica…) como forma de mejora en la toma de decisiones.
• Construir el Observatorio Ciudadano.
• Facilitar y apoyar todos los procesos de participación ciudadana mediante el apoyo técnico al trabajo del Área de Participación Ciudadana, Igualdad y Empoderamiento Ciudadano.

d) Asesoría jurídica municipal

• Dependiendo directamente del Alcalde, su Titular (Director/a) ejercerá las funciones atribuidas por la LRBRL: asistencia y asesoramiento jurídico al Alcalde, a la Junta de Gobierno Local y a los órganos directivos, dirección de la defensa y representación en juicio, contratación.
• En el ejercicio de sus funciones, su Titular (Director/a) emitirá las instrucciones y órdenes de servicio que fueran necesarias.
• Dependiendo directamente de la Dirección de la Asesoría Jurídica, quien ostente la Titularidad del órgano de apoyo a la Junta de Gobierno ejercerá las funciones atribuidas por la LRBRL, así como las de coordinación de los servicios jurídicos.